课程介绍

随着人类基因组计划的完成和海量生物数据的涌现,我们已经步入了一个令人激动的生物世纪!在这个生物世纪,不断解析和揭示生命的秘密将成为人类科学探索和科学进步的主战场!面对不断涌现的海量生物数据,如何有效地存储、管理、分析这些生物数据,如何准确地解读其中的生命规律,以及如何对生命现象进行诠释和预测,成为摆在人们面前的巨大难题。而生物信息学正是解决此难题的重要科学。 生物信息学(Bioinformatics),又称计算生物学(Computational Biology),是综合采用应用数学、统计学、信息科学、计算机科学以及物理学和化学等学科理论和工具,以分析、预测和了解生物数据及其生物学意义的一门学科,其主要研究内容包括生物信息学数据的收集、存储、管理与提供、基因组序列信息的提取和分析、功能基因组相关信息分析、生物大分子结构模拟和药物设计、生物信息分析的技术与方法研究及生物信息应用与发展研究。 本课程是医学检验专业、医学生物技术及相关专业的选修课,是引导学生入门为目标。本课程旨在让学生熟悉和了解生物信息学的背景知识、基本研究内容、基本分析流程及相关分析方法和工具软件,使学生对生物数据(核酸及蛋白质数据)及其查询、处理与分析、以及基因/蛋白质的结构预测和功能分析有较好地熟悉和了解,基本形成本学科的一些基本思维和方法,以及获得对生物信息分析结果进行基本判断和解释的能力。 本课程需要您具备一定的生物化学及分子生物学背景知识(背景知识相当重要,这是您听懂和理解生物信息学相关知识的基础。您可以登录系统,进入"试题试卷"对自己的生物学背景知识进行评估,从而决定是否选修此门课程),以及具备浏览英文站点及文献的能力。 本课程参考相关书籍和资料(见篇末列表),以自编讲义为载体,结合我校院生物技术专业和医学检验专业学生特点设计相应的教学内容,共36学时,如下: 生物信息学简介 学时 2(课件:PDF) 生物信息学背景知识基础(1)-------生物学背景知识 学时2(课件:PDF) 生物信息学背景知识基础(2)-------Linux系统及知识 学时 3(课件:PDF) 生物信息学背景知识基础(3)-------信息搜索及获取技术 学时3(课件:PDF) 生物信息工具及软件 学时 3(课件:PDF) 公共数据库及生物信息网站 学时 3(课件:PDF) Genbank数据库的检索与使用 学时 4(课件:PDF) 序列比对 学时 4(课件:PDF) 基因/基因组注释I、II、III 学时 12(课件:PDF1、PDF2) 参考书籍及资料 1、生物信息培训教材(华大基因中心) 2、生物信息学基因和蛋白质分析的实用指南(李衍达 译) 3、Bioinformatics-Sequence and Genome Analysis(David W. Mount) 4、生物信息学与功能基因组学(孙之荣 译) 5、基于WWW的生物信息学应用指南(李桂源、钱骏) 6、生物信息学分析实践(吴祖建、高芳銮、沈建国) 7、生物信息学基础(孙啸、陆祖宏、谢建明) 8、理解生物信息学(M.泽瓦勒贝、JO.鲍姆) 拓展参考资料: 参考站点 BioInfoServ生物信息系统 华中农大生物信息学精品课程:http://nhjy.hzau.edu.cn/kech/swxxx/ 北大实用生物信息学课程:http://abc.cbi.pku.edu.cn/ 作业示例文档:http://abc.cbi.pku.edu.cn/seminar/

课程通知 >>更多
  • 补课通知 2013-11-01
  • 期末作业 2013-10-30
  • 关于本课程栏目“生物信息在线” 2013-09-09
  • 幻灯PDF重新转换下载 2013-09-08
  • 关于问卷调查 2013-08-29
  • 课程注册及相关事项通知 2013-08-29
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